Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLPTM1LQ96KA5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLPTM1LQ96KA5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLPTM1LQ96KA5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLPTM1LQ96KA5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLPTM1LQ96KA5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLPTM1LQ96KA5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLPTM1LQ96KA5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLPTM1LQ96KA5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLPTM1LQ96KA5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLPTM1LQ96KA5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLPTM1LQ96KA5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLPTM1LQ96KA5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLPTM1LQ96KA5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLPTM1LQ96KA5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLPTM1LQ96KA5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLPTM1LQ96KA5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLPTM1LQ96KA5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLPTM1LQ96KA5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLPTM1LQ96KA5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLPTM1LQ96KA5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLPTM1LQ96KA5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLPTM1LQ96KA5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLPTM1LQ96KA5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLPTM1LQ96KA5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLPTM1LQ96KA5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLPTM1LQ96KA5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLPTM1LQ96KA5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLPTM1LQ96KA5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLPTM1LQ96KA5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLPTM1LQ96KA5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLPTM1LQ96KA5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLPTM1LQ96KA5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLPTM1LQ96KA5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLPTM1LQ96KA5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLPTM1LQ96KA5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLPTM1LQ96KA5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLPTM1LQ96KA5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLPTM1LQ96KA5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLPTM1LQ96KA5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLPTM1LQ96KA5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLPTM1LQ96KA5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLPTM1LQ96KA5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLPTM1LQ96KA5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLPTM1LQ96KA5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLPTM1LQ96KA5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CLPTM1LQ96KA5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLPTM1LQ96KA5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLPTM1LQ96KA5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLPTM1LQ96KA5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLPTM1LQ96KA5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLPTM1LQ96KA5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLPTM1LQ96KA5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLPTM1LQ96KA5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLPTM1LQ96KA5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLPTM1LQ96KA5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLPTM1LQ96KA5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLPTM1LQ96KA5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLPTM1LQ96KA5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPTM1LQ96KA5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPTM1LQ96KA5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPTM1LQ96KA5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPTM1LQ96KA5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLPTM1LQ96KA5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLPTM1LQ96KA5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLPTM1LQ96KA5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLPTM1LQ96KA5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLPTM1LQ96KA5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLPTM1LQ96KA5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLPTM1LQ96KA5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLPTM1LQ96KA5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLPTM1LQ96KA5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLPTM1LQ96KA5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLPTM1LQ96KA5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLPTM1LQ96KA5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLPTM1LQ96KA5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLPTM1LQ96KA5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLPTM1LQ96KA5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLPTM1LQ96KA5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLPTM1LQ96KA5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLPTM1LQ96KA5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLPTM1LQ96KA5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLPTM1LQ96KA5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLPTM1LQ96KA5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLPTM1LQ96KA5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms