Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL3LQ92901 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL3LQ92901 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL3LQ92901 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL3LQ92901 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL3LQ92901 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL3LQ92901 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL3LQ92901 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL3LQ92901 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL3LQ92901 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL3LQ92901 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL3LQ92901 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL3LQ92901 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL3LQ92901 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL3LQ92901 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL3LQ92901 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL3LQ92901 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL3LQ92901 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL3LQ92901 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL3LQ92901 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL3LQ92901 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL3LQ92901 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL3LQ92901 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL3LQ92901 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL3LQ92901 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL3LQ92901 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL3LQ92901 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL3LQ92901 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL3LQ92901 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL3LQ92901 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL3LQ92901 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL3LQ92901 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL3LQ92901 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL3LQ92901 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL3LQ92901 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL3LQ92901 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPL3LQ92901 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL3LQ92901 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL3LQ92901 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL3LQ92901 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL3LQ92901 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL3LQ92901 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL3LQ92901 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL3LQ92901 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL3LQ92901 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL3LQ92901 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL3LQ92901 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL3LQ92901 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL3LQ92901 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL3LQ92901 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL3LQ92901 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL3LQ92901 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL3LQ92901 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL3LQ92901 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL3LQ92901 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL3LQ92901 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL3LQ92901 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL3LQ92901 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL3LQ92901 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL3LQ92901 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL3LQ92901 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL3LQ92901 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL3LQ92901 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL3LQ92901 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL3LQ92901 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL3LQ92901 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL3LQ92901 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL3LQ92901 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL3LQ92901 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL3LQ92901 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL3LQ92901 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL3LQ92901 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL3LQ92901 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL3LQ92901 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL3LQ92901 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL3LQ92901 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL3LQ92901 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL3LQ92901 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL3LQ92901 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL3LQ92901 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL3LQ92901 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL3LQ92901 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL3LQ92901 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL3LQ92901 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL3LQ92901 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL3LQ92901 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms