Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW12

PCNP, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNPQ8WW12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNPQ8WW12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNPQ8WW12 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCNPQ8WW12 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCNPQ8WW12 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCNPQ8WW12 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCNPQ8WW12 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCNPQ8WW12 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNPQ8WW12 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNPQ8WW12 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCNPQ8WW12 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNPQ8WW12 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNPQ8WW12 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNPQ8WW12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNPQ8WW12 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNPQ8WW12 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNPQ8WW12 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNPQ8WW12 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNPQ8WW12 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNPQ8WW12 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNPQ8WW12 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNPQ8WW12 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCNPQ8WW12 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNPQ8WW12 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNPQ8WW12 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNPQ8WW12 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNPQ8WW12 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNPQ8WW12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNPQ8WW12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNPQ8WW12 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNPQ8WW12 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNPQ8WW12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCNPQ8WW12 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNPQ8WW12 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNPQ8WW12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNPQ8WW12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNPQ8WW12 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNPQ8WW12 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNPQ8WW12 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCNPQ8WW12 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCNPQ8WW12 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNPQ8WW12 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNPQ8WW12 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNPQ8WW12 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNPQ8WW12 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNPQ8WW12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNPQ8WW12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNPQ8WW12 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PCNPQ8WW12 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCNPQ8WW12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNPQ8WW12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNPQ8WW12 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNPQ8WW12 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNPQ8WW12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNPQ8WW12 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNPQ8WW12 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNPQ8WW12 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNPQ8WW12 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNPQ8WW12 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNPQ8WW12 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNPQ8WW12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNPQ8WW12 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNPQ8WW12 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNPQ8WW12 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNPQ8WW12 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNPQ8WW12 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNPQ8WW12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNPQ8WW12 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNPQ8WW12 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNPQ8WW12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNPQ8WW12 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNPQ8WW12 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNPQ8WW12 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNPQ8WW12 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNPQ8WW12 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNPQ8WW12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNPQ8WW12 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNPQ8WW12 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNPQ8WW12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNPQ8WW12 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNPQ8WW12 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNPQ8WW12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNPQ8WW12 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNPQ8WW12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNPQ8WW12 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNPQ8WW12 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCNPQ8WW12 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNPQ8WW12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNPQ8WW12 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNPQ8WW12 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNPQ8WW12 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNPQ8WW12 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNPQ8WW12 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNPQ8WW12 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNPQ8WW12 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNPQ8WW12 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNPQ8WW12 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNPQ8WW12 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNPQ8WW12 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNPQ8WW12 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 684.6 ms