Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB3IL1Q8TBN0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB3IL1Q8TBN0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB3IL1Q8TBN0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB3IL1Q8TBN0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3IL1Q8TBN0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB3IL1Q8TBN0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB3IL1Q8TBN0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3IL1Q8TBN0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3IL1Q8TBN0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB3IL1Q8TBN0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB3IL1Q8TBN0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3IL1Q8TBN0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3IL1Q8TBN0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB3IL1Q8TBN0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB3IL1Q8TBN0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB3IL1Q8TBN0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB3IL1Q8TBN0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB3IL1Q8TBN0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3IL1Q8TBN0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3IL1Q8TBN0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB3IL1Q8TBN0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB3IL1Q8TBN0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB3IL1Q8TBN0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB3IL1Q8TBN0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB3IL1Q8TBN0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB3IL1Q8TBN0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB3IL1Q8TBN0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB3IL1Q8TBN0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3IL1Q8TBN0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3IL1Q8TBN0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB3IL1Q8TBN0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB3IL1Q8TBN0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB3IL1Q8TBN0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3IL1Q8TBN0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB3IL1Q8TBN0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB3IL1Q8TBN0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3IL1Q8TBN0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3IL1Q8TBN0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB3IL1Q8TBN0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB3IL1Q8TBN0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB3IL1Q8TBN0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB3IL1Q8TBN0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB3IL1Q8TBN0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB3IL1Q8TBN0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB3IL1Q8TBN0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB3IL1Q8TBN0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB3IL1Q8TBN0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB3IL1Q8TBN0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB3IL1Q8TBN0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB3IL1Q8TBN0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3IL1Q8TBN0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3IL1Q8TBN0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB3IL1Q8TBN0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3IL1Q8TBN0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3IL1Q8TBN0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3IL1Q8TBN0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3IL1Q8TBN0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3IL1Q8TBN0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB3IL1Q8TBN0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB3IL1Q8TBN0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB3IL1Q8TBN0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3IL1Q8TBN0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3IL1Q8TBN0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3IL1Q8TBN0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3IL1Q8TBN0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3IL1Q8TBN0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3IL1Q8TBN0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3IL1Q8TBN0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3IL1Q8TBN0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3IL1Q8TBN0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3IL1Q8TBN0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3IL1Q8TBN0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB3IL1Q8TBN0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB3IL1Q8TBN0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB3IL1Q8TBN0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB3IL1Q8TBN0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB3IL1Q8TBN0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB3IL1Q8TBN0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms