Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST4Q8NFU0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEST4Q8NFU0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEST4Q8NFU0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BEST4Q8NFU0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BEST4Q8NFU0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BEST4Q8NFU0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BEST4Q8NFU0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEST4Q8NFU0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEST4Q8NFU0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEST4Q8NFU0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEST4Q8NFU0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEST4Q8NFU0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEST4Q8NFU0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEST4Q8NFU0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEST4Q8NFU0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEST4Q8NFU0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEST4Q8NFU0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEST4Q8NFU0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST4Q8NFU0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEST4Q8NFU0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEST4Q8NFU0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BEST4Q8NFU0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BEST4Q8NFU0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BEST4Q8NFU0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BEST4Q8NFU0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BEST4Q8NFU0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BEST4Q8NFU0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BEST4Q8NFU0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST4Q8NFU0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST4Q8NFU0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BEST4Q8NFU0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEST4Q8NFU0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEST4Q8NFU0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BEST4Q8NFU0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST4Q8NFU0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEST4Q8NFU0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST4Q8NFU0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST4Q8NFU0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST4Q8NFU0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST4Q8NFU0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST4Q8NFU0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST4Q8NFU0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST4Q8NFU0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEST4Q8NFU0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST4Q8NFU0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEST4Q8NFU0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST4Q8NFU0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST4Q8NFU0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEST4Q8NFU0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEST4Q8NFU0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST4Q8NFU0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST4Q8NFU0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST4Q8NFU0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST4Q8NFU0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST4Q8NFU0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST4Q8NFU0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST4Q8NFU0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST4Q8NFU0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST4Q8NFU0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEST4Q8NFU0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEST4Q8NFU0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST4Q8NFU0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms