Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BHLHE22Q8NFJ8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BHLHE22Q8NFJ8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BHLHE22Q8NFJ8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BHLHE22Q8NFJ8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BHLHE22Q8NFJ8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BHLHE22Q8NFJ8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BHLHE22Q8NFJ8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BHLHE22Q8NFJ8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BHLHE22Q8NFJ8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BHLHE22Q8NFJ8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BHLHE22Q8NFJ8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BHLHE22Q8NFJ8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BHLHE22Q8NFJ8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BHLHE22Q8NFJ8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BHLHE22Q8NFJ8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BHLHE22Q8NFJ8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BHLHE22Q8NFJ8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BHLHE22Q8NFJ8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BHLHE22Q8NFJ8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BHLHE22Q8NFJ8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BHLHE22Q8NFJ8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BHLHE22Q8NFJ8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BHLHE22Q8NFJ8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BHLHE22Q8NFJ8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BHLHE22Q8NFJ8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BHLHE22Q8NFJ8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHE22Q8NFJ8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BHLHE22Q8NFJ8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BHLHE22Q8NFJ8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
BHLHE22Q8NFJ8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BHLHE22Q8NFJ8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BHLHE22Q8NFJ8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BHLHE22Q8NFJ8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BHLHE22Q8NFJ8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BHLHE22Q8NFJ8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BHLHE22Q8NFJ8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BHLHE22Q8NFJ8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BHLHE22Q8NFJ8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BHLHE22Q8NFJ8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BHLHE22Q8NFJ8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BHLHE22Q8NFJ8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BHLHE22Q8NFJ8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BHLHE22Q8NFJ8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BHLHE22Q8NFJ8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BHLHE22Q8NFJ8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BHLHE22Q8NFJ8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHLHE22Q8NFJ8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHLHE22Q8NFJ8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BHLHE22Q8NFJ8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BHLHE22Q8NFJ8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BHLHE22Q8NFJ8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BHLHE22Q8NFJ8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BHLHE22Q8NFJ8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BHLHE22Q8NFJ8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BHLHE22Q8NFJ8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BHLHE22Q8NFJ8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BHLHE22Q8NFJ8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BHLHE22Q8NFJ8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BHLHE22Q8NFJ8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BHLHE22Q8NFJ8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BHLHE22Q8NFJ8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BHLHE22Q8NFJ8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BHLHE22Q8NFJ8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BHLHE22Q8NFJ8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BHLHE22Q8NFJ8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BHLHE22Q8NFJ8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BHLHE22Q8NFJ8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BHLHE22Q8NFJ8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BHLHE22Q8NFJ8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BHLHE22Q8NFJ8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BHLHE22Q8NFJ8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BHLHE22Q8NFJ8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BHLHE22Q8NFJ8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BHLHE22Q8NFJ8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BHLHE22Q8NFJ8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BHLHE22Q8NFJ8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BHLHE22Q8NFJ8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BHLHE22Q8NFJ8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BHLHE22Q8NFJ8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BHLHE22Q8NFJ8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BHLHE22Q8NFJ8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BHLHE22Q8NFJ8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BHLHE22Q8NFJ8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BHLHE22Q8NFJ8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BHLHE22Q8NFJ8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BHLHE22Q8NFJ8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BHLHE22Q8NFJ8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BHLHE22Q8NFJ8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BHLHE22Q8NFJ8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BHLHE22Q8NFJ8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BHLHE22Q8NFJ8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BHLHE22Q8NFJ8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BHLHE22Q8NFJ8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BHLHE22Q8NFJ8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BHLHE22Q8NFJ8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHLHE22Q8NFJ8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHLHE22Q8NFJ8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms