Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZV5

RDH10, Retinol dehydrogenase 10, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH10Q8IZV5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RDH10Q8IZV5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RDH10Q8IZV5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RDH10Q8IZV5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RDH10Q8IZV5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDH10Q8IZV5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RDH10Q8IZV5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RDH10Q8IZV5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RDH10Q8IZV5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RDH10Q8IZV5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDH10Q8IZV5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RDH10Q8IZV5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RDH10Q8IZV5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDH10Q8IZV5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RDH10Q8IZV5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH10Q8IZV5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH10Q8IZV5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDH10Q8IZV5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDH10Q8IZV5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH10Q8IZV5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms