Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29P2Q8IUI4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29P2Q8IUI4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29P2Q8IUI4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29P2Q8IUI4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29P2Q8IUI4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29P2Q8IUI4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX29P2Q8IUI4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX29P2Q8IUI4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX29P2Q8IUI4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX29P2Q8IUI4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX29P2Q8IUI4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX29P2Q8IUI4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX29P2Q8IUI4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX29P2Q8IUI4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX29P2Q8IUI4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX29P2Q8IUI4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX29P2Q8IUI4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX29P2Q8IUI4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX29P2Q8IUI4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX29P2Q8IUI4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX29P2Q8IUI4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX29P2Q8IUI4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX29P2Q8IUI4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX29P2Q8IUI4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX29P2Q8IUI4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29P2Q8IUI4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29P2Q8IUI4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29P2Q8IUI4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX29P2Q8IUI4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX29P2Q8IUI4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX29P2Q8IUI4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX29P2Q8IUI4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX29P2Q8IUI4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX29P2Q8IUI4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX29P2Q8IUI4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX29P2Q8IUI4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX29P2Q8IUI4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29P2Q8IUI4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX29P2Q8IUI4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX29P2Q8IUI4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX29P2Q8IUI4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29P2Q8IUI4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29P2Q8IUI4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29P2Q8IUI4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29P2Q8IUI4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29P2Q8IUI4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29P2Q8IUI4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29P2Q8IUI4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX29P2Q8IUI4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX29P2Q8IUI4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX29P2Q8IUI4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX29P2Q8IUI4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX29P2Q8IUI4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX29P2Q8IUI4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX29P2Q8IUI4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX29P2Q8IUI4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX29P2Q8IUI4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29P2Q8IUI4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29P2Q8IUI4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX29P2Q8IUI4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX29P2Q8IUI4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX29P2Q8IUI4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX29P2Q8IUI4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX29P2Q8IUI4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX29P2Q8IUI4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX29P2Q8IUI4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX29P2Q8IUI4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29P2Q8IUI4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29P2Q8IUI4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX29P2Q8IUI4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29P2Q8IUI4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX29P2Q8IUI4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX29P2Q8IUI4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX29P2Q8IUI4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX29P2Q8IUI4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX29P2Q8IUI4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29P2Q8IUI4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29P2Q8IUI4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX29P2Q8IUI4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29P2Q8IUI4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX29P2Q8IUI4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29P2Q8IUI4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29P2Q8IUI4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms