Protein–RNA interactions for Protein: Q86VR2

RETREG3, Reticulophagy regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG3Q86VR2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RETREG3Q86VR2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RETREG3Q86VR2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RETREG3Q86VR2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RETREG3Q86VR2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RETREG3Q86VR2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RETREG3Q86VR2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RETREG3Q86VR2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RETREG3Q86VR2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RETREG3Q86VR2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RETREG3Q86VR2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RETREG3Q86VR2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RETREG3Q86VR2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RETREG3Q86VR2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RETREG3Q86VR2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RETREG3Q86VR2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RETREG3Q86VR2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RETREG3Q86VR2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RETREG3Q86VR2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RETREG3Q86VR2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RETREG3Q86VR2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RETREG3Q86VR2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RETREG3Q86VR2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RETREG3Q86VR2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RETREG3Q86VR2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RETREG3Q86VR2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RETREG3Q86VR2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RETREG3Q86VR2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RETREG3Q86VR2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RETREG3Q86VR2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RETREG3Q86VR2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RETREG3Q86VR2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RETREG3Q86VR2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RETREG3Q86VR2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RETREG3Q86VR2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RETREG3Q86VR2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RETREG3Q86VR2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RETREG3Q86VR2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RETREG3Q86VR2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RETREG3Q86VR2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RETREG3Q86VR2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RETREG3Q86VR2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RETREG3Q86VR2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RETREG3Q86VR2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RETREG3Q86VR2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RETREG3Q86VR2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RETREG3Q86VR2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RETREG3Q86VR2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RETREG3Q86VR2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RETREG3Q86VR2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RETREG3Q86VR2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RETREG3Q86VR2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RETREG3Q86VR2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RETREG3Q86VR2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RETREG3Q86VR2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RETREG3Q86VR2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RETREG3Q86VR2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RETREG3Q86VR2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RETREG3Q86VR2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RETREG3Q86VR2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RETREG3Q86VR2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RETREG3Q86VR2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RETREG3Q86VR2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RETREG3Q86VR2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RETREG3Q86VR2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RETREG3Q86VR2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RETREG3Q86VR2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RETREG3Q86VR2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RETREG3Q86VR2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RETREG3Q86VR2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RETREG3Q86VR2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RETREG3Q86VR2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RETREG3Q86VR2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RETREG3Q86VR2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RETREG3Q86VR2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RETREG3Q86VR2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RETREG3Q86VR2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RETREG3Q86VR2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RETREG3Q86VR2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RETREG3Q86VR2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RETREG3Q86VR2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RETREG3Q86VR2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RETREG3Q86VR2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RETREG3Q86VR2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RETREG3Q86VR2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RETREG3Q86VR2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RETREG3Q86VR2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RETREG3Q86VR2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RETREG3Q86VR2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RETREG3Q86VR2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RETREG3Q86VR2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RETREG3Q86VR2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RETREG3Q86VR2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RETREG3Q86VR2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RETREG3Q86VR2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RETREG3Q86VR2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RETREG3Q86VR2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RETREG3Q86VR2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RETREG3Q86VR2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RETREG3Q86VR2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms