Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 61.7
DHX30Q7L2E3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 61.7
DHX30Q7L2E3 TSNARE1-203ENST00000518928 940 ntTSL 316.69■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 61.7
DHX30Q7L2E3 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.86□□□□□ -1.153e-20■■■■■ 60.9
DHX30Q7L2E3 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.057e-24■■■■■ 60.6
DHX30Q7L2E3 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.22■□□□□ 0.192e-10■■■■■ 59.1
DHX30Q7L2E3 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt12.99□□□□□ -0.332e-10■■■■■ 59.1
DHX30Q7L2E3 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt12.61□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 59.1
DHX30Q7L2E3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.126e-8■■■■■ 58.8
DHX30Q7L2E3 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)21.08■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 58.8
DHX30Q7L2E3 APBA2-209ENST00000559709 594 ntTSL 428.46■■■□□ 2.155e-8■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 APBA2-210ENST00000559814 2555 ntTSL 1 (best)20.11■□□□□ 0.815e-8■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 CIZ1-209ENST00000420484 684 ntTSL 335.06■■■■□ 3.21e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.941e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 BTBD2-206ENST00000589200 858 ntTSL 526.93■■□□□ 1.91e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.781e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 CIZ1-211ENST00000467178 904 ntTSL 326.08■■□□□ 1.771e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.61e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 SLC35B2-203ENST00000495706 1859 ntTSL 325.03■■□□□ 1.61e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 XXYLT1-210ENST00000491138 738 ntTSL 324.83■■□□□ 1.574e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 XXYLT1-208ENST00000473200 698 ntTSL 224.3■■□□□ 1.484e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.484e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 SEPT9-229ENST00000590576 583 ntTSL 323.97■■□□□ 1.431e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 CIZ1-221ENST00000488559 952 ntTSL 523.8■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 FLT3LG-210ENST00000600084 1057 ntTSL 1 (best)23.19■■□□□ 1.31e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 XXYLT1-203ENST00000418940 582 ntTSL 422.77■■□□□ 1.244e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.111e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.111e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.091e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 SEPT9-222ENST00000589070 582 ntTSL 321.83■■□□□ 1.091e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 CIZ1-218ENST00000476727 1205 ntTSL 520.96■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 SEPT9-241ENST00000591934 553 ntTSL 420.49■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 KLHDC4-225ENST00000569487 2072 ntTSL 219.92■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.694e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 SEPT9-231ENST00000590595 569 ntTSL 319.32■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 FLT3LG-212ENST00000601800 1032 ntTSL 518.47■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 SEPT9-240ENST00000591833 576 ntTSL 416.95■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 SEPT9-217ENST00000587237 548 ntTSL 516.9■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 SEPT9-242ENST00000592098 503 ntTSL 415.51■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 CIZ1-225ENST00000538431 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 CIZ1-202ENST00000324544 809 ntTSL 313.06□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 MIR4647-201ENST00000583964 80 ntBASIC12.99□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 CIZ1-228ENST00000634901 3462 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.393e-14■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 DOCK6-207ENST00000587656 4009 ntTSL 511.98□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 FLT3LG-202ENST00000593422 563 ntTSL 311.76□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 FLT3LG-203ENST00000594009 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 TMCO3-204ENST00000462877 491 ntTSL 29.67□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 58.5
DHX30Q7L2E3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.575e-8■■■■■ 56.5
DHX30Q7L2E3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.345e-8■■■■■ 56.5
DHX30Q7L2E3 ARHGEF4-207ENST00000438985 1638 ntTSL 215.61■□□□□ 0.095e-8■■■■■ 56.5
DHX30Q7L2E3 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.115e-8■■■■■ 56.5
DHX30Q7L2E3 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.285e-8■■■■■ 56.5
DHX30Q7L2E3 ARHGEF4-218ENST00000636987 3656 ntTSL 212.92□□□□□ -0.345e-8■■■■■ 56.5
DHX30Q7L2E3 ARHGEF4-203ENST00000392953 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.92□□□□□ -0.345e-8■■■■■ 56.5
DHX30Q7L2E3 ARHGEF4-201ENST00000326016 3666 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.485e-8■■■■■ 56.5
DHX30Q7L2E3 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.566e-10■■■■■ 56.3
DHX30Q7L2E3 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 516.8■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 56.3
DHX30Q7L2E3 TSPEAR-AS2-203ENST00000465978 345 ntTSL 514.61□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 55.6
DHX30Q7L2E3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.683e-6■■■■■ 55.2
DHX30Q7L2E3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.623e-6■■■■■ 55.2
DHX30Q7L2E3 GET4-207ENST00000483469 370 ntTSL 221.63■■□□□ 1.052e-13■■■■■ 55.2
DHX30Q7L2E3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 55.2
DHX30Q7L2E3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 55.2
DHX30Q7L2E3 PLEKHM1-202ENST00000446609 2825 ntTSL 516.72■□□□□ 0.276e-9■■■■■ 54.4
DHX30Q7L2E3 PLEKHM1-207ENST00000581448 3292 ntTSL 1 (best)13.6□□□□□ -0.236e-9■■■■■ 54.4
DHX30Q7L2E3 PLEKHM1-204ENST00000579197 4995 ntTSL 213.12□□□□□ -0.316e-9■■■■■ 54.4
DHX30Q7L2E3 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.346e-9■■■■■ 54.4
DHX30Q7L2E3 MTRNR2L4-201ENST00000399974 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.46e-9■■■■■ 54.4
DHX30Q7L2E3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.512e-6■■■■■ 54.1
DHX30Q7L2E3 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 323.38■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 54.1
DHX30Q7L2E3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 54.1
DHX30Q7L2E3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 54.1
DHX30Q7L2E3 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 521.29■■□□□ 12e-6■■■■■ 54.1
DHX30Q7L2E3 D2HGDH-214ENST00000473126 1612 ntTSL 1 (best)28.07■■■□□ 2.088e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 D2HGDH-215ENST00000486953 2232 ntTSL 1 (best)24.95■■□□□ 1.588e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.568e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 D2HGDH-202ENST00000400769 2277 ntTSL 224.35■■□□□ 1.498e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ESPN-213ENST00000632803 455 ntTSL 323.52■■□□□ 1.368e-7■■■■■ 52
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