Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.438e-10■■■■■ 44.5
LARP4Q71RC2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.238e-10■■■■■ 44.5
LARP4Q71RC2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.238e-10■■■■■ 44.5
LARP4Q71RC2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.118e-10■■■■■ 44.5
LARP4Q71RC2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.18e-10■■■■■ 44.5
LARP4Q71RC2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.18e-10■■■■■ 44.5
LARP4Q71RC2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.128e-10■■■■■ 44.5
LARP4Q71RC2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.228e-10■■■■■ 44.5
LARP4Q71RC2 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.558e-10■■■■■ 44.5
LARP4Q71RC2 ANAPC11-205ENST00000571570 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.938e-10■■■■■ 44.5
LARP4Q71RC2 LMNA-211ENST00000470199 551 ntTSL 416.52■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 44.3
LARP4Q71RC2 LMNA-219ENST00000502751 570 ntTSL 415.03■□□□□ -01e-8■■■■■ 44.3
LARP4Q71RC2 LMNA-210ENST00000469565 591 ntTSL 412.82□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 44.3
LARP4Q71RC2 PTH2R-202ENST00000419079 811 ntTSL 25.69□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 44.3
LARP4Q71RC2 PET100-206ENST00000601829 317 ntTSL 211.02□□□□□ -0.651e-9■■■■■ 44.3
LARP4Q71RC2 PET100-205ENST00000601406 332 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.711e-9■■■■■ 44.3
LARP4Q71RC2 GPT2-204ENST00000562801 2092 ntTSL 214.93□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 44.2
LARP4Q71RC2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-11■■■■■ 44
LARP4Q71RC2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.081e-11■■■■■ 44
LARP4Q71RC2 TMEM258-203ENST00000535297 395 ntTSL 212.62□□□□□ -0.391e-11■■■■■ 44
LARP4Q71RC2 TMEM258-202ENST00000535042 921 ntTSL 312.28□□□□□ -0.441e-11■■■■■ 44
LARP4Q71RC2 TMEM258-208ENST00000545210 579 ntTSL 310.32□□□□□ -0.761e-11■■■■■ 44
LARP4Q71RC2 TMEM258-201ENST00000257262 468 ntTSL 37.84□□□□□ -1.151e-11■■■■■ 44
LARP4Q71RC2 TMEM258-206ENST00000541893 517 ntTSL 55.19□□□□□ -1.581e-11■■■■■ 44
LARP4Q71RC2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.176e-11■■■■■ 43.8
LARP4Q71RC2 NDUFB7-202ENST00000593353 529 ntTSL 214.01□□□□□ -0.176e-11■■■■■ 43.8
LARP4Q71RC2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 06e-11■■■■■ 43.6
LARP4Q71RC2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.156e-11■■■■■ 43.6
LARP4Q71RC2 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.36e-11■■■■■ 43.6
LARP4Q71RC2 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.576e-11■■■■■ 43.6
LARP4Q71RC2 AC074032.1-201ENST00000548468 698 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.766e-11■■■■■ 43.6
LARP4Q71RC2 AC074032.1-202ENST00000552815 467 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.136e-11■■■■■ 43.6
LARP4Q71RC2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.83e-11■■■■■ 43.4
LARP4Q71RC2 RTN2-210ENST00000591286 2111 ntTSL 1 (best)25.84■■□□□ 1.733e-11■■■■■ 43.4
LARP4Q71RC2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.553e-11■■■■■ 43.4
LARP4Q71RC2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.483e-11■■■■■ 43.4
LARP4Q71RC2 RTN2-204ENST00000587597 2212 ntTSL 524.25■■□□□ 1.473e-11■■■■■ 43.4
LARP4Q71RC2 RTN2-203ENST00000430715 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.643e-11■■■■■ 43.4
LARP4Q71RC2 RTN2-205ENST00000588036 546 ntTSL 49.38□□□□□ -0.913e-11■■■■■ 43.4
LARP4Q71RC2 CD63-205ENST00000548117 499 ntTSL 210.78□□□□□ -0.686e-13■■■■■ 43.4
LARP4Q71RC2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.178e-10■■■■■ 43.2
LARP4Q71RC2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.317e-12■■■■■ 43
LARP4Q71RC2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.277e-12■■■■■ 43
LARP4Q71RC2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.247e-12■■■■■ 43
LARP4Q71RC2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 17e-12■■■■■ 43
LARP4Q71RC2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.357e-12■■■■■ 43
LARP4Q71RC2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.167e-12■■■■■ 43
LARP4Q71RC2 SMOX-206ENST00000457205 1669 ntTSL 515.89■□□□□ 0.137e-12■■■■■ 43
LARP4Q71RC2 SMOX-209ENST00000486998 702 ntTSL 214.08□□□□□ -0.167e-12■■■■■ 43
LARP4Q71RC2 SMOX-211ENST00000494098 812 ntTSL 58.85□□□□□ -0.997e-12■■■■■ 43
LARP4Q71RC2 MT1F-203ENST00000567672 317 ntTSL 36.98□□□□□ -1.297e-12■■■■■ 43
LARP4Q71RC2 RPP21-229ENST00000498414 1492 ntTSL 521.96■■□□□ 1.111e-11■■■■■ 42.8
LARP4Q71RC2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.911e-11■■■■■ 42.8
LARP4Q71RC2 RPP21-226ENST00000473266 621 ntTSL 519.6■□□□□ 0.731e-11■■■■■ 42.8
LARP4Q71RC2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.031e-11■■■■■ 42.8
LARP4Q71RC2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.031e-11■■■■■ 42.8
LARP4Q71RC2 RPP21-228ENST00000491477 457 ntTSL 515.26■□□□□ 0.031e-11■■■■■ 42.8
LARP4Q71RC2 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-11■■■■■ 42.8
LARP4Q71RC2 RPP21-223ENST00000436442 522 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.011e-11■■■■■ 42.8
LARP4Q71RC2 RPP21-227ENST00000489124 450 ntTSL 34.89□□□□□ -1.631e-11■■■■■ 42.8
LARP4Q71RC2 EIF5A-209ENST00000573714 602 ntTSL 319.04■□□□□ 0.642e-11■■■■■ 42.8
LARP4Q71RC2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.632e-11■■■■■ 42.7
LARP4Q71RC2 ETHE1-202ENST00000594342 702 ntTSL 210.98□□□□□ -0.652e-11■■■■■ 42.7
LARP4Q71RC2 TOM1-216ENST00000492723 2568 ntTSL 216.57■□□□□ 0.243e-7■■■■■ 42.2
LARP4Q71RC2 SPIDR-220ENST00000522900 692 ntTSL 317.04■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 42.1
LARP4Q71RC2 SPIDR-221ENST00000523814 802 ntTSL 515.26■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 42.1
LARP4Q71RC2 SPIDR-204ENST00000517824 849 ntTSL 510.6□□□□□ -0.715e-7■■■■■ 42.1
LARP4Q71RC2 SPIDR-218ENST00000522222 585 ntTSL 46.51□□□□□ -1.375e-7■■■■■ 42.1
LARP4Q71RC2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.221e-11■■■■■ 41.8
LARP4Q71RC2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-11■■■■■ 41.8
LARP4Q71RC2 CLPP-203ENST00000596070 1346 ntTSL 514.49□□□□□ -0.091e-11■■■■■ 41.8
LARP4Q71RC2 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.551e-11■■■■■ 41.8
LARP4Q71RC2 PSMB8-205ENST00000490613 835 ntTSL 210.49□□□□□ -0.731e-11■■■■■ 41.8
LARP4Q71RC2 PSMB8-204ENST00000484003 1153 ntTSL 510.03□□□□□ -0.81e-11■■■■■ 41.8
LARP4Q71RC2 CLPP-204ENST00000596149 745 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.821e-11■■■■■ 41.8
LARP4Q71RC2 NDUFB9-205ENST00000518657 672 ntTSL 27.98□□□□□ -1.136e-11■■■■■ 41.8
LARP4Q71RC2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.324e-10■■■■■ 41.6
LARP4Q71RC2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.37e-10■■■■■ 41.6
LARP4Q71RC2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.097e-10■■■■■ 41.6
LARP4Q71RC2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.017e-10■■■■■ 41.6
LARP4Q71RC2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 41.5
LARP4Q71RC2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.285e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 MPG-202ENST00000356432 1205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)18.01■□□□□ 0.475e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.365e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.145e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 MPG-204ENST00000436333 884 ntTSL 215.73■□□□□ 0.115e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.6□□□□□ -0.235e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.465e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 SETD2-203ENST00000412450 4231 ntTSL 211.34□□□□□ -0.595e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 EP400NL-208ENST00000475841 7090 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.885e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 ADAM10-203ENST00000402627 861 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -15e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 ADAM10-214ENST00000559053 541 ntTSL 47.77□□□□□ -1.175e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.175e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.455e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 SETD2-201ENST00000330022 8172 ntTSL 1 (best)5.43□□□□□ -1.545e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 NCAM2-205ENST00000486367 583 ntTSL 35.42□□□□□ -1.545e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 SETD2-204ENST00000431180 7555 ntTSL 25.4□□□□□ -1.545e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 ZNF117-202ENST00000487644 1837 ntTSL 24.72□□□□□ -1.655e-8■■■■■ 41.4
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