Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1A2

LPCAT3, Lysophospholipid acyltransferase 5, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3Q6P1A2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT3Q6P1A2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT3Q6P1A2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT3Q6P1A2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT3Q6P1A2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT3Q6P1A2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT3Q6P1A2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT3Q6P1A2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT3Q6P1A2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT3Q6P1A2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LPCAT3Q6P1A2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT3Q6P1A2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT3Q6P1A2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT3Q6P1A2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT3Q6P1A2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT3Q6P1A2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT3Q6P1A2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT3Q6P1A2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT3Q6P1A2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT3Q6P1A2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT3Q6P1A2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT3Q6P1A2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT3Q6P1A2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT3Q6P1A2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT3Q6P1A2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT3Q6P1A2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT3Q6P1A2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPCAT3Q6P1A2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPCAT3Q6P1A2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT3Q6P1A2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPCAT3Q6P1A2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPCAT3Q6P1A2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT3Q6P1A2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT3Q6P1A2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT3Q6P1A2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT3Q6P1A2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT3Q6P1A2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LPCAT3Q6P1A2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPCAT3Q6P1A2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPCAT3Q6P1A2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPCAT3Q6P1A2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPCAT3Q6P1A2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPCAT3Q6P1A2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPCAT3Q6P1A2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT3Q6P1A2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT3Q6P1A2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT3Q6P1A2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT3Q6P1A2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT3Q6P1A2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT3Q6P1A2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT3Q6P1A2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT3Q6P1A2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT3Q6P1A2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT3Q6P1A2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT3Q6P1A2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT3Q6P1A2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT3Q6P1A2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT3Q6P1A2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT3Q6P1A2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT3Q6P1A2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT3Q6P1A2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT3Q6P1A2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT3Q6P1A2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT3Q6P1A2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT3Q6P1A2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT3Q6P1A2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT3Q6P1A2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT3Q6P1A2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3Q6P1A2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LPCAT3Q6P1A2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms