Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATG16L1Q676U5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG16L1Q676U5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG16L1Q676U5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG16L1Q676U5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG16L1Q676U5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG16L1Q676U5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATG16L1Q676U5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG16L1Q676U5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG16L1Q676U5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATG16L1Q676U5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG16L1Q676U5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG16L1Q676U5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG16L1Q676U5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG16L1Q676U5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG16L1Q676U5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG16L1Q676U5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG16L1Q676U5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG16L1Q676U5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG16L1Q676U5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG16L1Q676U5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG16L1Q676U5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG16L1Q676U5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG16L1Q676U5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG16L1Q676U5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG16L1Q676U5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG16L1Q676U5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG16L1Q676U5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG16L1Q676U5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG16L1Q676U5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG16L1Q676U5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG16L1Q676U5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG16L1Q676U5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG16L1Q676U5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG16L1Q676U5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG16L1Q676U5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG16L1Q676U5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG16L1Q676U5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG16L1Q676U5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG16L1Q676U5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG16L1Q676U5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG16L1Q676U5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG16L1Q676U5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG16L1Q676U5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG16L1Q676U5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG16L1Q676U5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG16L1Q676U5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG16L1Q676U5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATG16L1Q676U5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG16L1Q676U5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG16L1Q676U5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG16L1Q676U5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG16L1Q676U5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG16L1Q676U5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG16L1Q676U5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG16L1Q676U5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG16L1Q676U5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG16L1Q676U5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG16L1Q676U5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG16L1Q676U5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG16L1Q676U5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG16L1Q676U5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG16L1Q676U5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG16L1Q676U5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATG16L1Q676U5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG16L1Q676U5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATG16L1Q676U5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG16L1Q676U5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG16L1Q676U5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG16L1Q676U5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG16L1Q676U5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG16L1Q676U5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG16L1Q676U5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG16L1Q676U5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG16L1Q676U5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG16L1Q676U5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG16L1Q676U5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG16L1Q676U5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG16L1Q676U5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG16L1Q676U5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG16L1Q676U5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG16L1Q676U5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG16L1Q676U5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG16L1Q676U5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG16L1Q676U5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms