Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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