Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PXDC1Q5TGL8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PXDC1Q5TGL8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PXDC1Q5TGL8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PXDC1Q5TGL8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PXDC1Q5TGL8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PXDC1Q5TGL8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PXDC1Q5TGL8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PXDC1Q5TGL8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PXDC1Q5TGL8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PXDC1Q5TGL8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PXDC1Q5TGL8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PXDC1Q5TGL8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PXDC1Q5TGL8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PXDC1Q5TGL8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PXDC1Q5TGL8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PXDC1Q5TGL8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PXDC1Q5TGL8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PXDC1Q5TGL8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PXDC1Q5TGL8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PXDC1Q5TGL8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXDC1Q5TGL8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXDC1Q5TGL8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXDC1Q5TGL8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PXDC1Q5TGL8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXDC1Q5TGL8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXDC1Q5TGL8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PXDC1Q5TGL8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms