Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXB2

UBE2NL, Putative ubiquitin-conjugating enzyme E2 N-like, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NLQ5JXB2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2NLQ5JXB2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2NLQ5JXB2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2NLQ5JXB2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2NLQ5JXB2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2NLQ5JXB2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2NLQ5JXB2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2NLQ5JXB2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2NLQ5JXB2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2NLQ5JXB2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2NLQ5JXB2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2NLQ5JXB2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2NLQ5JXB2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2NLQ5JXB2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2NLQ5JXB2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2NLQ5JXB2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2NLQ5JXB2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2NLQ5JXB2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2NLQ5JXB2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2NLQ5JXB2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2NLQ5JXB2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2NLQ5JXB2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2NLQ5JXB2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2NLQ5JXB2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2NLQ5JXB2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2NLQ5JXB2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2NLQ5JXB2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2NLQ5JXB2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2NLQ5JXB2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2NLQ5JXB2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2NLQ5JXB2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2NLQ5JXB2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2NLQ5JXB2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2NLQ5JXB2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2NLQ5JXB2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2NLQ5JXB2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2NLQ5JXB2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2NLQ5JXB2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE2NLQ5JXB2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE2NLQ5JXB2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2NLQ5JXB2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2NLQ5JXB2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2NLQ5JXB2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2NLQ5JXB2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2NLQ5JXB2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2NLQ5JXB2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2NLQ5JXB2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2NLQ5JXB2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2NLQ5JXB2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2NLQ5JXB2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2NLQ5JXB2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2NLQ5JXB2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2NLQ5JXB2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2NLQ5JXB2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2NLQ5JXB2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2NLQ5JXB2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2NLQ5JXB2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2NLQ5JXB2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2NLQ5JXB2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2NLQ5JXB2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2NLQ5JXB2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2NLQ5JXB2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2NLQ5JXB2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2NLQ5JXB2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2NLQ5JXB2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2NLQ5JXB2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2NLQ5JXB2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2NLQ5JXB2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2NLQ5JXB2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2NLQ5JXB2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2NLQ5JXB2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2NLQ5JXB2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2NLQ5JXB2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2NLQ5JXB2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2NLQ5JXB2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2NLQ5JXB2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2NLQ5JXB2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2NLQ5JXB2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2NLQ5JXB2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2NLQ5JXB2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2NLQ5JXB2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2NLQ5JXB2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms