Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL22Q53GT1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL22Q53GT1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL22Q53GT1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL22Q53GT1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL22Q53GT1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL22Q53GT1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL22Q53GT1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL22Q53GT1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL22Q53GT1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL22Q53GT1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL22Q53GT1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL22Q53GT1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL22Q53GT1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL22Q53GT1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL22Q53GT1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL22Q53GT1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL22Q53GT1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL22Q53GT1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL22Q53GT1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL22Q53GT1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL22Q53GT1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL22Q53GT1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL22Q53GT1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL22Q53GT1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL22Q53GT1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL22Q53GT1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL22Q53GT1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL22Q53GT1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL22Q53GT1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL22Q53GT1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL22Q53GT1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL22Q53GT1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL22Q53GT1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL22Q53GT1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL22Q53GT1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL22Q53GT1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL22Q53GT1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL22Q53GT1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL22Q53GT1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL22Q53GT1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL22Q53GT1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL22Q53GT1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL22Q53GT1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL22Q53GT1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL22Q53GT1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL22Q53GT1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL22Q53GT1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL22Q53GT1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL22Q53GT1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL22Q53GT1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL22Q53GT1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL22Q53GT1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL22Q53GT1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL22Q53GT1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL22Q53GT1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL22Q53GT1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL22Q53GT1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL22Q53GT1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL22Q53GT1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL22Q53GT1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL22Q53GT1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL22Q53GT1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL22Q53GT1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL22Q53GT1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL22Q53GT1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL22Q53GT1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL22Q53GT1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL22Q53GT1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL22Q53GT1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL22Q53GT1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL22Q53GT1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL22Q53GT1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms