Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4orf46Q504U0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4orf46Q504U0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4orf46Q504U0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4orf46Q504U0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4orf46Q504U0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4orf46Q504U0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4orf46Q504U0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C4orf46Q504U0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4orf46Q504U0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C4orf46Q504U0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4orf46Q504U0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4orf46Q504U0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf46Q504U0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf46Q504U0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4orf46Q504U0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4orf46Q504U0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C4orf46Q504U0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf46Q504U0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf46Q504U0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf46Q504U0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf46Q504U0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf46Q504U0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf46Q504U0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf46Q504U0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf46Q504U0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf46Q504U0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf46Q504U0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf46Q504U0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf46Q504U0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4orf46Q504U0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4orf46Q504U0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4orf46Q504U0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf46Q504U0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf46Q504U0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf46Q504U0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf46Q504U0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4orf46Q504U0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4orf46Q504U0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf46Q504U0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4orf46Q504U0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4orf46Q504U0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf46Q504U0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4orf46Q504U0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf46Q504U0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf46Q504U0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4orf46Q504U0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf46Q504U0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4orf46Q504U0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4orf46Q504U0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4orf46Q504U0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4orf46Q504U0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4orf46Q504U0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C4orf46Q504U0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4orf46Q504U0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4orf46Q504U0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4orf46Q504U0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4orf46Q504U0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4orf46Q504U0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf46Q504U0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
C4orf46Q504U0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4orf46Q504U0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf46Q504U0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf46Q504U0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4orf46Q504U0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C4orf46Q504U0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf46Q504U0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf46Q504U0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf46Q504U0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf46Q504U0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4orf46Q504U0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf46Q504U0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf46Q504U0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf46Q504U0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4orf46Q504U0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4orf46Q504U0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf46Q504U0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf46Q504U0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms