Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P11Q13670 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P11Q13670 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P11Q13670 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS2P11Q13670 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P11Q13670 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P11Q13670 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P11Q13670 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P11Q13670 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P11Q13670 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P11Q13670 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P11Q13670 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P11Q13670 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P11Q13670 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P11Q13670 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P11Q13670 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P11Q13670 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P11Q13670 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P11Q13670 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMS2P11Q13670 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMS2P11Q13670 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMS2P11Q13670 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMS2P11Q13670 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PMS2P11Q13670 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMS2P11Q13670 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PMS2P11Q13670 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PMS2P11Q13670 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMS2P11Q13670 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PMS2P11Q13670 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PMS2P11Q13670 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMS2P11Q13670 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMS2P11Q13670 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P11Q13670 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P11Q13670 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMS2P11Q13670 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMS2P11Q13670 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMS2P11Q13670 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMS2P11Q13670 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P11Q13670 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P11Q13670 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMS2P11Q13670 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P11Q13670 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P11Q13670 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMS2P11Q13670 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P11Q13670 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P11Q13670 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P11Q13670 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P11Q13670 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P11Q13670 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P11Q13670 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P11Q13670 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMS2P11Q13670 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMS2P11Q13670 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMS2P11Q13670 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMS2P11Q13670 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMS2P11Q13670 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMS2P11Q13670 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMS2P11Q13670 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMS2P11Q13670 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMS2P11Q13670 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMS2P11Q13670 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMS2P11Q13670 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMS2P11Q13670 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMS2P11Q13670 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMS2P11Q13670 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PMS2P11Q13670 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PMS2P11Q13670 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PMS2P11Q13670 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMS2P11Q13670 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMS2P11Q13670 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMS2P11Q13670 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMS2P11Q13670 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMS2P11Q13670 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMS2P11Q13670 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMS2P11Q13670 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P11Q13670 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P11Q13670 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMS2P11Q13670 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMS2P11Q13670 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMS2P11Q13670 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMS2P11Q13670 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMS2P11Q13670 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMS2P11Q13670 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMS2P11Q13670 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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