Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MADCAM1Q13477 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MADCAM1Q13477 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MADCAM1Q13477 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MADCAM1Q13477 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MADCAM1Q13477 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MADCAM1Q13477 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MADCAM1Q13477 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MADCAM1Q13477 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MADCAM1Q13477 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MADCAM1Q13477 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MADCAM1Q13477 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MADCAM1Q13477 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MADCAM1Q13477 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MADCAM1Q13477 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MADCAM1Q13477 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MADCAM1Q13477 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MADCAM1Q13477 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MADCAM1Q13477 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MADCAM1Q13477 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MADCAM1Q13477 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MADCAM1Q13477 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MADCAM1Q13477 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MADCAM1Q13477 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MADCAM1Q13477 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MADCAM1Q13477 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MADCAM1Q13477 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MADCAM1Q13477 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MADCAM1Q13477 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MADCAM1Q13477 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MADCAM1Q13477 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MADCAM1Q13477 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MADCAM1Q13477 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MADCAM1Q13477 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MADCAM1Q13477 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MADCAM1Q13477 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MADCAM1Q13477 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MADCAM1Q13477 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MADCAM1Q13477 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MADCAM1Q13477 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MADCAM1Q13477 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MADCAM1Q13477 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MADCAM1Q13477 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MADCAM1Q13477 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MADCAM1Q13477 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MADCAM1Q13477 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MADCAM1Q13477 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MADCAM1Q13477 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MADCAM1Q13477 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MADCAM1Q13477 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MADCAM1Q13477 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MADCAM1Q13477 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MADCAM1Q13477 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MADCAM1Q13477 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MADCAM1Q13477 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MADCAM1Q13477 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MADCAM1Q13477 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MADCAM1Q13477 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MADCAM1Q13477 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MADCAM1Q13477 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MADCAM1Q13477 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MADCAM1Q13477 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MADCAM1Q13477 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MADCAM1Q13477 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MADCAM1Q13477 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MADCAM1Q13477 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MADCAM1Q13477 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MADCAM1Q13477 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MADCAM1Q13477 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MADCAM1Q13477 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MADCAM1Q13477 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MADCAM1Q13477 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MADCAM1Q13477 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MADCAM1Q13477 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MADCAM1Q13477 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MADCAM1Q13477 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MADCAM1Q13477 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MADCAM1Q13477 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MADCAM1Q13477 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MADCAM1Q13477 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MADCAM1Q13477 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MADCAM1Q13477 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MADCAM1Q13477 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MADCAM1Q13477 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MADCAM1Q13477 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MADCAM1Q13477 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MADCAM1Q13477 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MADCAM1Q13477 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MADCAM1Q13477 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MADCAM1Q13477 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MADCAM1Q13477 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MADCAM1Q13477 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MADCAM1Q13477 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MADCAM1Q13477 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MADCAM1Q13477 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MADCAM1Q13477 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MADCAM1Q13477 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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