Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKZF1Q13422 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKZF1Q13422 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IKZF1Q13422 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IKZF1Q13422 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IKZF1Q13422 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IKZF1Q13422 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IKZF1Q13422 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IKZF1Q13422 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IKZF1Q13422 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IKZF1Q13422 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IKZF1Q13422 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IKZF1Q13422 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IKZF1Q13422 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IKZF1Q13422 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IKZF1Q13422 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IKZF1Q13422 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IKZF1Q13422 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IKZF1Q13422 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IKZF1Q13422 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IKZF1Q13422 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IKZF1Q13422 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IKZF1Q13422 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IKZF1Q13422 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IKZF1Q13422 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IKZF1Q13422 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IKZF1Q13422 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IKZF1Q13422 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IKZF1Q13422 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IKZF1Q13422 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IKZF1Q13422 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IKZF1Q13422 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IKZF1Q13422 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IKZF1Q13422 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IKZF1Q13422 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IKZF1Q13422 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IKZF1Q13422 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IKZF1Q13422 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IKZF1Q13422 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IKZF1Q13422 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKZF1Q13422 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKZF1Q13422 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKZF1Q13422 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKZF1Q13422 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKZF1Q13422 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKZF1Q13422 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IKZF1Q13422 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IKZF1Q13422 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKZF1Q13422 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKZF1Q13422 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKZF1Q13422 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKZF1Q13422 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKZF1Q13422 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IKZF1Q13422 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IKZF1Q13422 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IKZF1Q13422 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IKZF1Q13422 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKZF1Q13422 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IKZF1Q13422 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKZF1Q13422 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IKZF1Q13422 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IKZF1Q13422 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IKZF1Q13422 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKZF1Q13422 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKZF1Q13422 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IKZF1Q13422 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKZF1Q13422 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IKZF1Q13422 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKZF1Q13422 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKZF1Q13422 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKZF1Q13422 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKZF1Q13422 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKZF1Q13422 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKZF1Q13422 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKZF1Q13422 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKZF1Q13422 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKZF1Q13422 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKZF1Q13422 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKZF1Q13422 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKZF1Q13422 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IKZF1Q13422 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms