Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 WSC2YNL283C 1512 nt10.51□□□□□ -0.73
TAF3Q12297 BNA2YJR078W 1362 nt10.51□□□□□ -0.73
TAF3Q12297 TRM5YHR070W 1500 nt10.48□□□□□ -0.73
TAF3Q12297 YGR259CYGR259C 441 nt10.47□□□□□ -0.73
TAF3Q12297 CYT2YKL087C 675 nt10.47□□□□□ -0.73
TAF3Q12297 YCL074WYCL074W 927 nt10.46□□□□□ -0.73
TAF3Q12297 GAL1YBR020W 1587 nt10.46□□□□□ -0.74
TAF3Q12297 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.45□□□□□ -0.74
TAF3Q12297 FMP45YDL222C 930 nt10.45□□□□□ -0.74
TAF3Q12297 YOR139CYOR139C 393 nt10.45□□□□□ -0.74
TAF3Q12297 PBP1YGR178C 2169 nt10.45□□□□□ -0.74
TAF3Q12297 IRC24YIR036C 792 nt10.43□□□□□ -0.74
TAF3Q12297 FRD1YEL047C 1413 nt10.4□□□□□ -0.75
TAF3Q12297 AGP1YCL025C 1902 nt10.39□□□□□ -0.75
TAF3Q12297 DIC1YLR348C 897 nt10.39□□□□□ -0.75
TAF3Q12297 ANP1YEL036C 1503 nt10.38□□□□□ -0.75
TAF3Q12297 CMP2YML057W 1815 nt10.38□□□□□ -0.75
TAF3Q12297 PUS2YGL063W 1113 nt10.37□□□□□ -0.75
TAF3Q12297 MIC12YBR262C 321 nt10.36□□□□□ -0.75
TAF3Q12297 HHO1YPL127C 777 nt10.35□□□□□ -0.75
TAF3Q12297 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.35□□□□□ -0.75
TAF3Q12297 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.35□□□□□ -0.75
TAF3Q12297 YKR040CYKR040C 504 nt10.34□□□□□ -0.75
TAF3Q12297 ERV46YAL042W 1248 nt10.3□□□□□ -0.76
TAF3Q12297 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.29□□□□□ -0.76
TAF3Q12297 LPX1YOR084W 1164 nt10.29□□□□□ -0.76
TAF3Q12297 YPR011CYPR011C 981 nt10.29□□□□□ -0.76
TAF3Q12297 AQY1YPR192W 918 nt10.29□□□□□ -0.76
TAF3Q12297 FEN2YCR028C 1539 nt10.27□□□□□ -0.77
TAF3Q12297 STB1YNL309W 1263 nt10.26□□□□□ -0.77
TAF3Q12297 GPI16YHR188C 1833 nt10.22□□□□□ -0.77
TAF3Q12297 SPC25YER018C 666 nt10.22□□□□□ -0.77
TAF3Q12297 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.21□□□□□ -0.77
TAF3Q12297 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.21□□□□□ -0.77
TAF3Q12297 YAT1YAR035W 2064 nt10.19□□□□□ -0.78
TAF3Q12297 STR3YGL184C 1398 nt10.19□□□□□ -0.78
TAF3Q12297 YGR201CYGR201C 678 nt10.19□□□□□ -0.78
TAF3Q12297 YIR016WYIR016W 798 nt10.19□□□□□ -0.78
TAF3Q12297 NDI1YML120C 1542 nt10.18□□□□□ -0.78
TAF3Q12297 XDJ1YLR090W 1380 nt10.18□□□□□ -0.78
TAF3Q12297 AQY2YLL052C 450 nt10.16□□□□□ -0.78
TAF3Q12297 VPS60YDR486C 690 nt10.13□□□□□ -0.79
TAF3Q12297 YLR179CYLR179C 606 nt10.12□□□□□ -0.79
TAF3Q12297 DUT1YBR252W 444 nt10.12□□□□□ -0.79
TAF3Q12297 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.11□□□□□ -0.79
TAF3Q12297 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.11□□□□□ -0.79
TAF3Q12297 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.11□□□□□ -0.79
TAF3Q12297 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.11□□□□□ -0.79
TAF3Q12297 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.11□□□□□ -0.79
TAF3Q12297 TIM23YNR017W 669 nt10.11□□□□□ -0.79
TAF3Q12297 CCT4YDL143W 1587 nt10.1□□□□□ -0.79
TAF3Q12297 RTN2YDL204W 1182 nt10.09□□□□□ -0.79
TAF3Q12297 PTH1YHR189W 573 nt10.09□□□□□ -0.79
TAF3Q12297 SWC5YBR231C 912 nt10.09□□□□□ -0.79
TAF3Q12297 GOR1YNL274C 1053 nt10.07□□□□□ -0.8
TAF3Q12297 AVT6YER119C 1347 nt10.07□□□□□ -0.8
TAF3Q12297 FRE6YLL051C 2139 nt10.06□□□□□ -0.8
TAF3Q12297 ALG3YBL082C 1377 nt10.06□□□□□ -0.8
TAF3Q12297 GDH3YAL062W 1374 nt10.05□□□□□ -0.8
TAF3Q12297 HSL7YBR133C 2484 nt10.04□□□□□ -0.8
TAF3Q12297 SSN3YPL042C 1668 nt10.04□□□□□ -0.8
TAF3Q12297 YLR235CYLR235C 399 nt10.04□□□□□ -0.8
TAF3Q12297 SPT20YOL148C 1815 nt10.03□□□□□ -0.8
TAF3Q12297 INA1YLR413W 2028 nt9.99□□□□□ -0.81
TAF3Q12297 AHT1YHR093W 549 nt9.98□□□□□ -0.81
TAF3Q12297 RPC82YPR190C 1965 nt9.92□□□□□ -0.82
TAF3Q12297 HIF1YLL022C 1158 nt9.91□□□□□ -0.82
TAF3Q12297 YPR064WYPR064W 420 nt9.9□□□□□ -0.82
TAF3Q12297 ALD4YOR374W 1560 nt9.89□□□□□ -0.83
TAF3Q12297 HEL2YDR266C 1920 nt9.89□□□□□ -0.83
TAF3Q12297 PLB1YMR008C 1995 nt9.87□□□□□ -0.83
TAF3Q12297 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.87□□□□□ -0.83
TAF3Q12297 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.87□□□□□ -0.83
TAF3Q12297 PRM5YIL117C 957 nt9.86□□□□□ -0.83
TAF3Q12297 RIM8YGL045W 1629 nt9.83□□□□□ -0.84
TAF3Q12297 YKL030WYKL030W 606 nt9.82□□□□□ -0.84
TAF3Q12297 SPP1YPL138C 1062 nt9.81□□□□□ -0.84
TAF3Q12297 MET2YNL277W 1461 nt9.8□□□□□ -0.84
TAF3Q12297 TAD3YLR316C 969 nt9.8□□□□□ -0.84
TAF3Q12297 GID7YCL039W 2238 nt9.8□□□□□ -0.84
TAF3Q12297 SHM2YLR058C 1410 nt9.8□□□□□ -0.84
TAF3Q12297 SFP1YLR403W 2052 nt9.78□□□□□ -0.84
TAF3Q12297 ARP6YLR085C 1317 nt9.77□□□□□ -0.85
TAF3Q12297 NPP1YCR026C 2229 nt9.75□□□□□ -0.85
TAF3Q12297 MUP1YGR055W 1725 nt9.74□□□□□ -0.85
TAF3Q12297 NBP35YGL091C 987 nt9.74□□□□□ -0.85
TAF3Q12297 TIM17YJL143W 477 nt9.74□□□□□ -0.85
TAF3Q12297 DAT1YML113W 747 nt9.74□□□□□ -0.85
TAF3Q12297 BSP1YPR171W 1731 nt9.73□□□□□ -0.85
TAF3Q12297 ZRT3YKL175W 1512 nt9.72□□□□□ -0.85
TAF3Q12297 YCR102CYCR102C 1107 nt9.72□□□□□ -0.85
TAF3Q12297 YLR415CYLR415C 339 nt9.72□□□□□ -0.85
TAF3Q12297 YGL114WYGL114W 2178 nt9.7□□□□□ -0.86
TAF3Q12297 UTR1YJR049C 1593 nt9.69□□□□□ -0.86
TAF3Q12297 BDH1YAL060W 1149 nt9.69□□□□□ -0.86
TAF3Q12297 SAM35YHR083W 990 nt9.68□□□□□ -0.86
TAF3Q12297 NIT1YIL164C 600 nt9.66□□□□□ -0.86
TAF3Q12297 HOL1YNR055C 1761 nt9.63□□□□□ -0.87
TAF3Q12297 YJL067WYJL067W 351 nt9.61□□□□□ -0.87
TAF3Q12297 SGT2YOR007C 1041 nt9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms