Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPXP78539 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPXP78539 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPXP78539 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPXP78539 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPXP78539 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPXP78539 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPXP78539 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPXP78539 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPXP78539 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPXP78539 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPXP78539 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPXP78539 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPXP78539 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPXP78539 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPXP78539 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPXP78539 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPXP78539 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPXP78539 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPXP78539 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPXP78539 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPXP78539 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPXP78539 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPXP78539 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPXP78539 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPXP78539 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPXP78539 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPXP78539 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPXP78539 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPXP78539 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPXP78539 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPXP78539 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPXP78539 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPXP78539 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPXP78539 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPXP78539 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPXP78539 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPXP78539 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPXP78539 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPXP78539 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPXP78539 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPXP78539 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPXP78539 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPXP78539 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPXP78539 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPXP78539 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPXP78539 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPXP78539 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPXP78539 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPXP78539 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPXP78539 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPXP78539 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPXP78539 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPXP78539 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPXP78539 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPXP78539 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPXP78539 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPXP78539 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPXP78539 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRPXP78539 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPXP78539 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPXP78539 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPXP78539 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPXP78539 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPXP78539 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPXP78539 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPXP78539 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPXP78539 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPXP78539 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPXP78539 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPXP78539 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPXP78539 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPXP78539 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPXP78539 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPXP78539 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPXP78539 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPXP78539 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPXP78539 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPXP78539 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPXP78539 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPXP78539 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPXP78539 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPXP78539 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPXP78539 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPXP78539 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPXP78539 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPXP78539 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPXP78539 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPXP78539 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPXP78539 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPXP78539 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPXP78539 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPXP78539 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPXP78539 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPXP78539 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPXP78539 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPXP78539 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPXP78539 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPXP78539 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPXP78539 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms