Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63121 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63121 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63121 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63121 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63121 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63121 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63121 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63121 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63121 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63121 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63121 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63121 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63121 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63121 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63121 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63121 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63121 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63121 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63121 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63121 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P63121 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P63121 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERVK_113P63121 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERVK_113P63121 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63121 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63121 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63121 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63121 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63121 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63121 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63121 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63121 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63121 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63121 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63121 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63121 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63121 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63121 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63121 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63121 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P63121 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P63121 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63121 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63121 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63121 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P63121 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HERVK_113P63121 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P63121 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63121 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERVK_113P63121 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63121 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63121 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63121 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P63121 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P63121 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63121 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63121 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63121 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P63121 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63121 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P63121 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63121 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P63121 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63121 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P63121 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P63121 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms