Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD23AP54725 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD23AP54725 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD23AP54725 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD23AP54725 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD23AP54725 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD23AP54725 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD23AP54725 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RAD23AP54725 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD23AP54725 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD23AP54725 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD23AP54725 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD23AP54725 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD23AP54725 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD23AP54725 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAD23AP54725 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD23AP54725 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD23AP54725 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD23AP54725 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD23AP54725 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD23AP54725 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD23AP54725 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD23AP54725 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD23AP54725 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAD23AP54725 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAD23AP54725 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD23AP54725 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAD23AP54725 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD23AP54725 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD23AP54725 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD23AP54725 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD23AP54725 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD23AP54725 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RAD23AP54725 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD23AP54725 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD23AP54725 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD23AP54725 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD23AP54725 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD23AP54725 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD23AP54725 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD23AP54725 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD23AP54725 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD23AP54725 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD23AP54725 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD23AP54725 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD23AP54725 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD23AP54725 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD23AP54725 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD23AP54725 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD23AP54725 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD23AP54725 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD23AP54725 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD23AP54725 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD23AP54725 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD23AP54725 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD23AP54725 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD23AP54725 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms