Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP2S1P53680 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP2S1P53680 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP2S1P53680 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
AP2S1P53680 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
AP2S1P53680 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP2S1P53680 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP2S1P53680 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP2S1P53680 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP2S1P53680 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP2S1P53680 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP2S1P53680 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP2S1P53680 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP2S1P53680 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP2S1P53680 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP2S1P53680 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP2S1P53680 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP2S1P53680 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP2S1P53680 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP2S1P53680 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP2S1P53680 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP2S1P53680 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AP2S1P53680 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AP2S1P53680 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP2S1P53680 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP2S1P53680 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP2S1P53680 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP2S1P53680 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP2S1P53680 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP2S1P53680 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP2S1P53680 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP2S1P53680 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP2S1P53680 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP2S1P53680 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP2S1P53680 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP2S1P53680 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP2S1P53680 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP2S1P53680 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AP2S1P53680 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP2S1P53680 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP2S1P53680 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP2S1P53680 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP2S1P53680 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP2S1P53680 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP2S1P53680 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP2S1P53680 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP2S1P53680 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP2S1P53680 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP2S1P53680 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP2S1P53680 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP2S1P53680 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP2S1P53680 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP2S1P53680 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP2S1P53680 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP2S1P53680 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP2S1P53680 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP2S1P53680 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP2S1P53680 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP2S1P53680 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP2S1P53680 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP2S1P53680 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP2S1P53680 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP2S1P53680 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP2S1P53680 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP2S1P53680 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP2S1P53680 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP2S1P53680 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP2S1P53680 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP2S1P53680 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP2S1P53680 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP2S1P53680 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP2S1P53680 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP2S1P53680 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP2S1P53680 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP2S1P53680 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP2S1P53680 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP2S1P53680 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP2S1P53680 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP2S1P53680 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP2S1P53680 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP2S1P53680 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP2S1P53680 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP2S1P53680 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP2S1P53680 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP2S1P53680 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP2S1P53680 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP2S1P53680 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP2S1P53680 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP2S1P53680 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP2S1P53680 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP2S1P53680 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP2S1P53680 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP2S1P53680 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP2S1P53680 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP2S1P53680 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP2S1P53680 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP2S1P53680 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP2S1P53680 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP2S1P53680 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP2S1P53680 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms