Protein–RNA interactions for Protein: P53145

LSG1, Large subunit GTPase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSG1P53145 PBP1YGR178C 2169 nt10.23□□□□□ -0.77
LSG1P53145 RNQ1YCL028W 1218 nt10.22□□□□□ -0.77
LSG1P53145 FUR4YBR021W 1902 nt10.21□□□□□ -0.77
LSG1P53145 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.21□□□□□ -0.77
LSG1P53145 YEL076CYEL076C 651 nt10.21□□□□□ -0.77
LSG1P53145 DIC1YLR348C 897 nt10.21□□□□□ -0.77
LSG1P53145 YLR464WYLR464W 651 nt10.21□□□□□ -0.77
LSG1P53145 ADO1YJR105W 1023 nt10.2□□□□□ -0.78
LSG1P53145 YKL030WYKL030W 606 nt10.19□□□□□ -0.78
LSG1P53145 ERF2YLR246W 1080 nt10.18□□□□□ -0.78
LSG1P53145 DPS1YLL018C 1674 nt10.18□□□□□ -0.78
LSG1P53145 BIO5YNR056C 1686 nt10.16□□□□□ -0.78
LSG1P53145 BMT6YLR063W 1098 nt10.15□□□□□ -0.78
LSG1P53145 CRR1YLR213C 1269 nt10.15□□□□□ -0.78
LSG1P53145 TIM23YNR017W 669 nt10.14□□□□□ -0.79
LSG1P53145 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.14□□□□□ -0.79
LSG1P53145 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.14□□□□□ -0.79
LSG1P53145 YLL053CYLL053C 459 nt10.13□□□□□ -0.79
LSG1P53145 HUA1YGR268C 597 nt10.12□□□□□ -0.79
LSG1P53145 MET2YNL277W 1461 nt10.1□□□□□ -0.79
LSG1P53145 NDI1YML120C 1542 nt10.09□□□□□ -0.79
LSG1P53145 FTR1YER145C 1215 nt10.08□□□□□ -0.8
LSG1P53145 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.08□□□□□ -0.8
LSG1P53145 YLR179CYLR179C 606 nt10.08□□□□□ -0.8
LSG1P53145 AQY1YPR192W 918 nt10.06□□□□□ -0.8
LSG1P53145 HEM12YDR047W 1089 nt10.05□□□□□ -0.8
LSG1P53145 GAL1YBR020W 1587 nt10.03□□□□□ -0.8
LSG1P53145 ATF2YGR177C 1608 nt10.03□□□□□ -0.8
LSG1P53145 MIC10YCL057C-A 294 nt10.02□□□□□ -0.81
LSG1P53145 YFL067WYFL067W 528 nt10.01□□□□□ -0.81
LSG1P53145 YPR064WYPR064W 420 nt10.01□□□□□ -0.81
LSG1P53145 YAT1YAR035W 2064 nt10.01□□□□□ -0.81
LSG1P53145 TRM5YHR070W 1500 nt10.01□□□□□ -0.81
LSG1P53145 RAX1YOR301W 1308 nt10□□□□□ -0.81
LSG1P53145 SNG1YGR197C 1644 nt9.99□□□□□ -0.81
LSG1P53145 SNF1YDR477W 1902 nt9.99□□□□□ -0.81
LSG1P53145 AHT1YHR093W 549 nt9.98□□□□□ -0.81
LSG1P53145 DDR2YOL052C-A 186 nt9.98□□□□□ -0.81
LSG1P53145 CCA1YER168C 1641 nt9.97□□□□□ -0.81
LSG1P53145 WSC2YNL283C 1512 nt9.97□□□□□ -0.81
LSG1P53145 TAD3YLR316C 969 nt9.94□□□□□ -0.82
LSG1P53145 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.93□□□□□ -0.82
LSG1P53145 STB1YNL309W 1263 nt9.93□□□□□ -0.82
LSG1P53145 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.92□□□□□ -0.82
LSG1P53145 SPC25YER018C 666 nt9.92□□□□□ -0.82
LSG1P53145 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.9□□□□□ -0.82
LSG1P53145 GPI16YHR188C 1833 nt9.9□□□□□ -0.82
LSG1P53145 YKR005CYKR005C 1578 nt9.88□□□□□ -0.83
LSG1P53145 RIM8YGL045W 1629 nt9.88□□□□□ -0.83
LSG1P53145 SFP1YLR403W 2052 nt9.87□□□□□ -0.83
LSG1P53145 SPT20YOL148C 1815 nt9.87□□□□□ -0.83
LSG1P53145 ANP1YEL036C 1503 nt9.87□□□□□ -0.83
LSG1P53145 CCT4YDL143W 1587 nt9.86□□□□□ -0.83
LSG1P53145 MAE1YKL029C 2010 nt9.86□□□□□ -0.83
LSG1P53145 IRC24YIR036C 792 nt9.85□□□□□ -0.83
LSG1P53145 BNA2YJR078W 1362 nt9.84□□□□□ -0.83
LSG1P53145 FEN2YCR028C 1539 nt9.82□□□□□ -0.84
LSG1P53145 SWC5YBR231C 912 nt9.82□□□□□ -0.84
LSG1P53145 VPS60YDR486C 690 nt9.81□□□□□ -0.84
LSG1P53145 YDR094WYDR094W 336 nt9.8□□□□□ -0.84
LSG1P53145 YGL114WYGL114W 2178 nt9.8□□□□□ -0.84
LSG1P53145 MIC12YBR262C 321 nt9.79□□□□□ -0.84
LSG1P53145 BDH1YAL060W 1149 nt9.77□□□□□ -0.85
LSG1P53145 YLR415CYLR415C 339 nt9.77□□□□□ -0.85
LSG1P53145 NPP1YCR026C 2229 nt9.75□□□□□ -0.85
LSG1P53145 ALG3YBL082C 1377 nt9.75□□□□□ -0.85
LSG1P53145 AGP1YCL025C 1902 nt9.74□□□□□ -0.85
LSG1P53145 YIR016WYIR016W 798 nt9.73□□□□□ -0.85
LSG1P53145 UBX6YJL048C 1191 nt9.73□□□□□ -0.85
LSG1P53145 YFR018CYFR018C 1092 nt9.72□□□□□ -0.85
LSG1P53145 DUS1YML080W 1272 nt9.72□□□□□ -0.85
LSG1P53145 GID7YCL039W 2238 nt9.71□□□□□ -0.85
LSG1P53145 YCL074WYCL074W 927 nt9.71□□□□□ -0.86
LSG1P53145 YGR259CYGR259C 441 nt9.71□□□□□ -0.86
LSG1P53145 YSP3YOR003W 1437 nt9.71□□□□□ -0.86
LSG1P53145 HHO1YPL127C 777 nt9.7□□□□□ -0.86
LSG1P53145 PEX25YPL112C 1185 nt9.69□□□□□ -0.86
LSG1P53145 TPO4YOR273C 1980 nt9.66□□□□□ -0.86
LSG1P53145 INA1YLR413W 2028 nt9.65□□□□□ -0.87
LSG1P53145 UGA4YDL210W 1716 nt9.65□□□□□ -0.87
LSG1P53145 YNL115CYNL115C 1935 nt9.64□□□□□ -0.87
LSG1P53145 RRT5YFR032C 870 nt9.63□□□□□ -0.87
LSG1P53145 YGR201CYGR201C 678 nt9.63□□□□□ -0.87
LSG1P53145 ACO2YJL200C 2370 nt9.62□□□□□ -0.87
LSG1P53145 HMG2YLR450W 3138 nt9.61□□□□□ -0.87
LSG1P53145 YFL066CYFL066C 1179 nt9.6□□□□□ -0.87
LSG1P53145 XDJ1YLR090W 1380 nt9.6□□□□□ -0.87
LSG1P53145 TIM17YJL143W 477 nt9.59□□□□□ -0.87
LSG1P53145 PRE6YOL038W 765 nt9.59□□□□□ -0.87
LSG1P53145 RPC82YPR190C 1965 nt9.57□□□□□ -0.88
LSG1P53145 VPS75YNL246W 795 nt9.57□□□□□ -0.88
LSG1P53145 PAU16YKL224C 372 nt9.56□□□□□ -0.88
LSG1P53145 SSN3YPL042C 1668 nt9.55□□□□□ -0.88
LSG1P53145 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.55□□□□□ -0.88
LSG1P53145 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.55□□□□□ -0.88
LSG1P53145 STR3YGL184C 1398 nt9.54□□□□□ -0.88
LSG1P53145 SHM2YLR058C 1410 nt9.54□□□□□ -0.88
LSG1P53145 MUP1YGR055W 1725 nt9.53□□□□□ -0.88
LSG1P53145 GDH3YAL062W 1374 nt9.52□□□□□ -0.88
LSG1P53145 DUT1YBR252W 444 nt9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms