Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAP1GDS1P52306 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAP1GDS1P52306 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAP1GDS1P52306 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAP1GDS1P52306 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAP1GDS1P52306 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAP1GDS1P52306 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAP1GDS1P52306 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAP1GDS1P52306 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAP1GDS1P52306 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAP1GDS1P52306 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAP1GDS1P52306 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAP1GDS1P52306 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAP1GDS1P52306 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAP1GDS1P52306 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAP1GDS1P52306 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAP1GDS1P52306 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAP1GDS1P52306 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAP1GDS1P52306 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAP1GDS1P52306 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAP1GDS1P52306 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAP1GDS1P52306 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAP1GDS1P52306 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAP1GDS1P52306 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAP1GDS1P52306 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAP1GDS1P52306 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAP1GDS1P52306 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAP1GDS1P52306 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAP1GDS1P52306 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAP1GDS1P52306 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAP1GDS1P52306 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAP1GDS1P52306 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAP1GDS1P52306 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAP1GDS1P52306 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAP1GDS1P52306 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAP1GDS1P52306 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAP1GDS1P52306 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAP1GDS1P52306 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAP1GDS1P52306 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAP1GDS1P52306 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAP1GDS1P52306 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAP1GDS1P52306 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAP1GDS1P52306 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAP1GDS1P52306 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAP1GDS1P52306 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RAP1GDS1P52306 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAP1GDS1P52306 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAP1GDS1P52306 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAP1GDS1P52306 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAP1GDS1P52306 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RAP1GDS1P52306 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAP1GDS1P52306 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAP1GDS1P52306 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAP1GDS1P52306 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAP1GDS1P52306 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAP1GDS1P52306 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RAP1GDS1P52306 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAP1GDS1P52306 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAP1GDS1P52306 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAP1GDS1P52306 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAP1GDS1P52306 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAP1GDS1P52306 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAP1GDS1P52306 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAP1GDS1P52306 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAP1GDS1P52306 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RAP1GDS1P52306 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAP1GDS1P52306 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAP1GDS1P52306 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.2 ms