Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PCP4P48539 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCP4P48539 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PCP4P48539 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCP4P48539 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCP4P48539 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PCP4P48539 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PCP4P48539 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCP4P48539 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PCP4P48539 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCP4P48539 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PCP4P48539 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCP4P48539 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCP4P48539 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PCP4P48539 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCP4P48539 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PCP4P48539 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PCP4P48539 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCP4P48539 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCP4P48539 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCP4P48539 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PCP4P48539 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCP4P48539 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PCP4P48539 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCP4P48539 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCP4P48539 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCP4P48539 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCP4P48539 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCP4P48539 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCP4P48539 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCP4P48539 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCP4P48539 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCP4P48539 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCP4P48539 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCP4P48539 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCP4P48539 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCP4P48539 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCP4P48539 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCP4P48539 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCP4P48539 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCP4P48539 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCP4P48539 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCP4P48539 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCP4P48539 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCP4P48539 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCP4P48539 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCP4P48539 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCP4P48539 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCP4P48539 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCP4P48539 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCP4P48539 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCP4P48539 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCP4P48539 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCP4P48539 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCP4P48539 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCP4P48539 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCP4P48539 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCP4P48539 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCP4P48539 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCP4P48539 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCP4P48539 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PCP4P48539 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCP4P48539 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCP4P48539 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCP4P48539 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCP4P48539 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCP4P48539 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCP4P48539 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCP4P48539 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCP4P48539 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCP4P48539 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCP4P48539 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCP4P48539 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCP4P48539 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCP4P48539 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCP4P48539 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCP4P48539 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCP4P48539 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCP4P48539 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCP4P48539 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCP4P48539 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCP4P48539 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCP4P48539 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCP4P48539 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCP4P48539 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCP4P48539 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCP4P48539 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCP4P48539 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCP4P48539 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCP4P48539 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCP4P48539 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCP4P48539 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCP4P48539 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCP4P48539 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCP4P48539 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCP4P48539 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCP4P48539 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCP4P48539 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCP4P48539 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCP4P48539 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms