Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP2K4P45985 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP2K4P45985 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP2K4P45985 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP2K4P45985 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP2K4P45985 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP2K4P45985 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP2K4P45985 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP2K4P45985 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP2K4P45985 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP2K4P45985 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP2K4P45985 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP2K4P45985 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP2K4P45985 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP2K4P45985 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP2K4P45985 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP2K4P45985 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP2K4P45985 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP2K4P45985 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP2K4P45985 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP2K4P45985 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP2K4P45985 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP2K4P45985 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP2K4P45985 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP2K4P45985 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP2K4P45985 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP2K4P45985 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP2K4P45985 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP2K4P45985 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP2K4P45985 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP2K4P45985 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP2K4P45985 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP2K4P45985 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP2K4P45985 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP2K4P45985 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MAP2K4P45985 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAP2K4P45985 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP2K4P45985 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP2K4P45985 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP2K4P45985 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP2K4P45985 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP2K4P45985 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP2K4P45985 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP2K4P45985 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP2K4P45985 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MAP2K4P45985 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAP2K4P45985 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAP2K4P45985 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAP2K4P45985 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAP2K4P45985 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAP2K4P45985 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAP2K4P45985 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP2K4P45985 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP2K4P45985 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP2K4P45985 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP2K4P45985 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP2K4P45985 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP2K4P45985 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP2K4P45985 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP2K4P45985 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP2K4P45985 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP2K4P45985 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP2K4P45985 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP2K4P45985 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP2K4P45985 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP2K4P45985 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP2K4P45985 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP2K4P45985 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP2K4P45985 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP2K4P45985 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP2K4P45985 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP2K4P45985 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP2K4P45985 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP2K4P45985 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP2K4P45985 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP2K4P45985 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP2K4P45985 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP2K4P45985 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP2K4P45985 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP2K4P45985 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP2K4P45985 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAP2K4P45985 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAP2K4P45985 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms