Protein–RNA interactions for Protein: P43657

LPAR6, Lysophosphatidic acid receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR6P43657 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPAR6P43657 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LPAR6P43657 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPAR6P43657 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPAR6P43657 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPAR6P43657 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPAR6P43657 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPAR6P43657 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPAR6P43657 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPAR6P43657 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPAR6P43657 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPAR6P43657 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LPAR6P43657 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPAR6P43657 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPAR6P43657 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPAR6P43657 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPAR6P43657 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPAR6P43657 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPAR6P43657 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPAR6P43657 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPAR6P43657 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPAR6P43657 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPAR6P43657 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LPAR6P43657 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LPAR6P43657 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPAR6P43657 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPAR6P43657 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPAR6P43657 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPAR6P43657 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPAR6P43657 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPAR6P43657 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPAR6P43657 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPAR6P43657 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPAR6P43657 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPAR6P43657 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPAR6P43657 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPAR6P43657 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPAR6P43657 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LPAR6P43657 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPAR6P43657 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPAR6P43657 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPAR6P43657 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPAR6P43657 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPAR6P43657 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPAR6P43657 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPAR6P43657 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPAR6P43657 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPAR6P43657 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPAR6P43657 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPAR6P43657 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPAR6P43657 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPAR6P43657 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPAR6P43657 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPAR6P43657 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPAR6P43657 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPAR6P43657 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPAR6P43657 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPAR6P43657 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPAR6P43657 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPAR6P43657 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPAR6P43657 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPAR6P43657 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPAR6P43657 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPAR6P43657 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPAR6P43657 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPAR6P43657 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPAR6P43657 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPAR6P43657 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR6P43657 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPAR6P43657 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPAR6P43657 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPAR6P43657 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPAR6P43657 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LPAR6P43657 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPAR6P43657 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPAR6P43657 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPAR6P43657 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPAR6P43657 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPAR6P43657 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPAR6P43657 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPAR6P43657 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms