Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFI27P40305 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI27P40305 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI27P40305 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFI27P40305 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFI27P40305 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFI27P40305 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFI27P40305 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IFI27P40305 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFI27P40305 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IFI27P40305 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFI27P40305 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFI27P40305 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFI27P40305 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFI27P40305 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFI27P40305 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFI27P40305 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFI27P40305 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFI27P40305 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFI27P40305 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IFI27P40305 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFI27P40305 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFI27P40305 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFI27P40305 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFI27P40305 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFI27P40305 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFI27P40305 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFI27P40305 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFI27P40305 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFI27P40305 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFI27P40305 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFI27P40305 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFI27P40305 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFI27P40305 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFI27P40305 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFI27P40305 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFI27P40305 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFI27P40305 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFI27P40305 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFI27P40305 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFI27P40305 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFI27P40305 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFI27P40305 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFI27P40305 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFI27P40305 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFI27P40305 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFI27P40305 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFI27P40305 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFI27P40305 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFI27P40305 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFI27P40305 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFI27P40305 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFI27P40305 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFI27P40305 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFI27P40305 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFI27P40305 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFI27P40305 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFI27P40305 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFI27P40305 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFI27P40305 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IFI27P40305 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFI27P40305 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFI27P40305 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFI27P40305 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFI27P40305 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFI27P40305 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFI27P40305 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFI27P40305 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFI27P40305 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFI27P40305 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFI27P40305 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFI27P40305 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFI27P40305 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFI27P40305 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFI27P40305 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFI27P40305 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFI27P40305 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFI27P40305 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFI27P40305 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFI27P40305 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFI27P40305 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFI27P40305 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFI27P40305 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFI27P40305 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFI27P40305 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFI27P40305 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFI27P40305 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFI27P40305 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFI27P40305 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFI27P40305 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFI27P40305 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFI27P40305 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFI27P40305 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFI27P40305 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IFI27P40305 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFI27P40305 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFI27P40305 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFI27P40305 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFI27P40305 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFI27P40305 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms