Protein–RNA interactions for Protein: P35367

HRH1, Histamine H1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRH1P35367 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HRH1P35367 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HRH1P35367 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HRH1P35367 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HRH1P35367 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HRH1P35367 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HRH1P35367 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HRH1P35367 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HRH1P35367 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRH1P35367 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRH1P35367 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRH1P35367 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRH1P35367 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRH1P35367 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRH1P35367 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRH1P35367 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HRH1P35367 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRH1P35367 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRH1P35367 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HRH1P35367 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRH1P35367 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRH1P35367 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRH1P35367 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HRH1P35367 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HRH1P35367 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HRH1P35367 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HRH1P35367 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HRH1P35367 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HRH1P35367 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HRH1P35367 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HRH1P35367 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HRH1P35367 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HRH1P35367 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HRH1P35367 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HRH1P35367 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HRH1P35367 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HRH1P35367 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HRH1P35367 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HRH1P35367 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HRH1P35367 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HRH1P35367 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HRH1P35367 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HRH1P35367 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HRH1P35367 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HRH1P35367 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HRH1P35367 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HRH1P35367 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HRH1P35367 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HRH1P35367 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRH1P35367 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HRH1P35367 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRH1P35367 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRH1P35367 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRH1P35367 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRH1P35367 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRH1P35367 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRH1P35367 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRH1P35367 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRH1P35367 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRH1P35367 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRH1P35367 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRH1P35367 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HRH1P35367 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HRH1P35367 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HRH1P35367 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HRH1P35367 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HRH1P35367 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HRH1P35367 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HRH1P35367 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRH1P35367 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HRH1P35367 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRH1P35367 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRH1P35367 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRH1P35367 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HRH1P35367 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HRH1P35367 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HRH1P35367 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HRH1P35367 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HRH1P35367 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HRH1P35367 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRH1P35367 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HRH1P35367 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HRH1P35367 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HRH1P35367 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HRH1P35367 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HRH1P35367 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HRH1P35367 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HRH1P35367 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HRH1P35367 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HRH1P35367 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRH1P35367 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRH1P35367 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRH1P35367 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRH1P35367 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRH1P35367 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRH1P35367 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRH1P35367 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRH1P35367 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRH1P35367 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRH1P35367 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms