Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCND1P24385 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCND1P24385 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCND1P24385 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCND1P24385 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCND1P24385 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCND1P24385 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCND1P24385 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCND1P24385 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCND1P24385 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCND1P24385 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCND1P24385 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCND1P24385 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCND1P24385 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCND1P24385 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCND1P24385 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCND1P24385 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCND1P24385 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCND1P24385 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCND1P24385 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCND1P24385 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCND1P24385 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCND1P24385 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCND1P24385 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCND1P24385 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCND1P24385 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCND1P24385 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCND1P24385 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCND1P24385 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCND1P24385 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCND1P24385 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCND1P24385 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCND1P24385 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCND1P24385 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCND1P24385 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCND1P24385 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCND1P24385 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCND1P24385 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCND1P24385 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCND1P24385 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCND1P24385 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCND1P24385 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCND1P24385 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCND1P24385 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCND1P24385 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCND1P24385 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCND1P24385 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCND1P24385 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCND1P24385 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCND1P24385 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCND1P24385 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCND1P24385 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCND1P24385 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCND1P24385 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCND1P24385 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCND1P24385 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND1P24385 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND1P24385 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCND1P24385 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCND1P24385 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCND1P24385 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCND1P24385 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCND1P24385 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCND1P24385 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCND1P24385 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CCND1P24385 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND1P24385 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND1P24385 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND1P24385 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND1P24385 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND1P24385 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND1P24385 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCND1P24385 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND1P24385 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCND1P24385 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCND1P24385 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND1P24385 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCND1P24385 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCND1P24385 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCND1P24385 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCND1P24385 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCND1P24385 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCND1P24385 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCND1P24385 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCND1P24385 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCND1P24385 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCND1P24385 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCND1P24385 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCND1P24385 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCND1P24385 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCND1P24385 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCND1P24385 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCND1P24385 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCND1P24385 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCND1P24385 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCND1P24385 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCND1P24385 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCND1P24385 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCND1P24385 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCND1P24385 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms