Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA5P20719 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA5P20719 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA5P20719 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA5P20719 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA5P20719 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA5P20719 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA5P20719 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA5P20719 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA5P20719 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA5P20719 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA5P20719 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA5P20719 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA5P20719 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA5P20719 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA5P20719 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA5P20719 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA5P20719 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA5P20719 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA5P20719 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA5P20719 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA5P20719 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA5P20719 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA5P20719 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA5P20719 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA5P20719 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA5P20719 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA5P20719 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA5P20719 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA5P20719 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA5P20719 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA5P20719 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA5P20719 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA5P20719 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA5P20719 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA5P20719 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA5P20719 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA5P20719 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA5P20719 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA5P20719 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA5P20719 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA5P20719 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA5P20719 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA5P20719 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA5P20719 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA5P20719 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA5P20719 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA5P20719 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA5P20719 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA5P20719 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA5P20719 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA5P20719 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA5P20719 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA5P20719 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA5P20719 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA5P20719 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA5P20719 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA5P20719 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA5P20719 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA5P20719 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA5P20719 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA5P20719 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA5P20719 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA5P20719 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA5P20719 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA5P20719 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA5P20719 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA5P20719 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA5P20719 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA5P20719 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA5P20719 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA5P20719 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA5P20719 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA5P20719 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA5P20719 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA5P20719 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA5P20719 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA5P20719 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA5P20719 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA5P20719 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA5P20719 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA5P20719 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA5P20719 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA5P20719 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA5P20719 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms