Protein–RNA interactions for Protein: P04406

GAPDH, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP04406 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GAPDHP04406 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GAPDHP04406 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPDHP04406 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GAPDHP04406 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPDHP04406 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GAPDHP04406 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GAPDHP04406 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GAPDHP04406 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPDHP04406 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GAPDHP04406 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GAPDHP04406 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPDHP04406 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPDHP04406 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GAPDHP04406 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAPDHP04406 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAPDHP04406 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GAPDHP04406 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GAPDHP04406 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPDHP04406 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPDHP04406 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GAPDHP04406 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPDHP04406 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPDHP04406 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GAPDHP04406 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPDHP04406 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPDHP04406 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPDHP04406 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPDHP04406 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPDHP04406 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAPDHP04406 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAPDHP04406 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPDHP04406 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPDHP04406 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPDHP04406 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPDHP04406 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHP04406 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHP04406 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHP04406 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHP04406 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHP04406 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPDHP04406 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GAPDHP04406 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GAPDHP04406 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPDHP04406 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPDHP04406 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GAPDHP04406 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPDHP04406 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPDHP04406 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GAPDHP04406 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GAPDHP04406 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPDHP04406 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPDHP04406 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPDHP04406 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPDHP04406 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAPDHP04406 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAPDHP04406 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms