Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPAN13O95857 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPAN13O95857 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPAN13O95857 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPAN13O95857 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPAN13O95857 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPAN13O95857 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPAN13O95857 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPAN13O95857 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPAN13O95857 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPAN13O95857 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPAN13O95857 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN13O95857 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN13O95857 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN13O95857 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN13O95857 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN13O95857 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN13O95857 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN13O95857 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN13O95857 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN13O95857 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN13O95857 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN13O95857 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN13O95857 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN13O95857 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN13O95857 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN13O95857 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSPAN13O95857 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPAN13O95857 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN13O95857 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPAN13O95857 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN13O95857 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPAN13O95857 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPAN13O95857 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSPAN13O95857 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSPAN13O95857 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSPAN13O95857 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSPAN13O95857 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSPAN13O95857 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSPAN13O95857 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSPAN13O95857 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSPAN13O95857 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSPAN13O95857 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSPAN13O95857 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSPAN13O95857 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSPAN13O95857 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TSPAN13O95857 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSPAN13O95857 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSPAN13O95857 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSPAN13O95857 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSPAN13O95857 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSPAN13O95857 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSPAN13O95857 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPAN13O95857 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPAN13O95857 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPAN13O95857 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPAN13O95857 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPAN13O95857 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPAN13O95857 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPAN13O95857 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPAN13O95857 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN13O95857 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN13O95857 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN13O95857 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN13O95857 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN13O95857 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPAN13O95857 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN13O95857 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN13O95857 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN13O95857 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN13O95857 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPAN13O95857 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms