Protein–RNA interactions for Protein: O95170

CDRT1, CMT1A duplicated region transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT1O95170 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDRT1O95170 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDRT1O95170 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDRT1O95170 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDRT1O95170 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDRT1O95170 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDRT1O95170 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDRT1O95170 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDRT1O95170 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDRT1O95170 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDRT1O95170 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDRT1O95170 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDRT1O95170 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDRT1O95170 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDRT1O95170 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDRT1O95170 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDRT1O95170 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDRT1O95170 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDRT1O95170 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDRT1O95170 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDRT1O95170 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDRT1O95170 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDRT1O95170 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDRT1O95170 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDRT1O95170 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDRT1O95170 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDRT1O95170 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDRT1O95170 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDRT1O95170 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDRT1O95170 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDRT1O95170 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDRT1O95170 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDRT1O95170 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDRT1O95170 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDRT1O95170 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDRT1O95170 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDRT1O95170 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDRT1O95170 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDRT1O95170 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDRT1O95170 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDRT1O95170 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDRT1O95170 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDRT1O95170 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDRT1O95170 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDRT1O95170 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDRT1O95170 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDRT1O95170 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDRT1O95170 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDRT1O95170 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDRT1O95170 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDRT1O95170 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDRT1O95170 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDRT1O95170 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDRT1O95170 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDRT1O95170 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDRT1O95170 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDRT1O95170 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDRT1O95170 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDRT1O95170 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDRT1O95170 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDRT1O95170 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDRT1O95170 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDRT1O95170 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDRT1O95170 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDRT1O95170 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDRT1O95170 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDRT1O95170 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDRT1O95170 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDRT1O95170 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDRT1O95170 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDRT1O95170 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDRT1O95170 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDRT1O95170 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDRT1O95170 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDRT1O95170 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDRT1O95170 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDRT1O95170 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDRT1O95170 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDRT1O95170 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDRT1O95170 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDRT1O95170 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDRT1O95170 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDRT1O95170 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDRT1O95170 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDRT1O95170 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms