Protein–RNA interactions for Protein: O43396

TXNL1, Thioredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1O43396 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms