Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC3O15379 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC3O15379 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC3O15379 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC3O15379 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC3O15379 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC3O15379 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC3O15379 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC3O15379 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC3O15379 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC3O15379 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC3O15379 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC3O15379 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC3O15379 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC3O15379 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC3O15379 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC3O15379 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC3O15379 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC3O15379 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC3O15379 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC3O15379 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC3O15379 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HDAC3O15379 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC3O15379 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC3O15379 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC3O15379 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC3O15379 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC3O15379 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC3O15379 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC3O15379 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDAC3O15379 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
HDAC3O15379 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC3O15379 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC3O15379 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC3O15379 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC3O15379 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC3O15379 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC3O15379 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC3O15379 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC3O15379 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC3O15379 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC3O15379 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC3O15379 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC3O15379 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC3O15379 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC3O15379 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC3O15379 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC3O15379 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC3O15379 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC3O15379 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC3O15379 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC3O15379 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC3O15379 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC3O15379 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC3O15379 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC3O15379 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC3O15379 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC3O15379 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC3O15379 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC3O15379 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC3O15379 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC3O15379 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC3O15379 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC3O15379 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC3O15379 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC3O15379 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC3O15379 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC3O15379 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC3O15379 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC3O15379 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC3O15379 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC3O15379 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC3O15379 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC3O15379 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC3O15379 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC3O15379 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC3O15379 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC3O15379 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC3O15379 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC3O15379 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC3O15379 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC3O15379 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC3O15379 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC3O15379 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC3O15379 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC3O15379 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC3O15379 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC3O15379 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC3O15379 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC3O15379 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC3O15379 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC3O15379 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC3O15379 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC3O15379 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC3O15379 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC3O15379 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC3O15379 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC3O15379 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC3O15379 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC3O15379 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms