Protein–RNA interactions for Protein: A6NEV1

PRR23A, Proline-rich protein 23A, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23AA6NEV1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRR23AA6NEV1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRR23AA6NEV1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRR23AA6NEV1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRR23AA6NEV1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRR23AA6NEV1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRR23AA6NEV1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRR23AA6NEV1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRR23AA6NEV1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRR23AA6NEV1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRR23AA6NEV1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PRR23AA6NEV1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRR23AA6NEV1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRR23AA6NEV1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PRR23AA6NEV1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRR23AA6NEV1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRR23AA6NEV1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRR23AA6NEV1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRR23AA6NEV1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRR23AA6NEV1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRR23AA6NEV1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRR23AA6NEV1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRR23AA6NEV1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRR23AA6NEV1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRR23AA6NEV1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRR23AA6NEV1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRR23AA6NEV1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRR23AA6NEV1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRR23AA6NEV1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRR23AA6NEV1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRR23AA6NEV1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRR23AA6NEV1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRR23AA6NEV1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRR23AA6NEV1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRR23AA6NEV1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRR23AA6NEV1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRR23AA6NEV1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRR23AA6NEV1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRR23AA6NEV1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRR23AA6NEV1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRR23AA6NEV1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRR23AA6NEV1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRR23AA6NEV1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRR23AA6NEV1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRR23AA6NEV1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRR23AA6NEV1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRR23AA6NEV1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRR23AA6NEV1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRR23AA6NEV1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRR23AA6NEV1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PRR23AA6NEV1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRR23AA6NEV1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRR23AA6NEV1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRR23AA6NEV1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRR23AA6NEV1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRR23AA6NEV1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRR23AA6NEV1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRR23AA6NEV1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRR23AA6NEV1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRR23AA6NEV1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRR23AA6NEV1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRR23AA6NEV1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRR23AA6NEV1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRR23AA6NEV1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRR23AA6NEV1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRR23AA6NEV1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRR23AA6NEV1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRR23AA6NEV1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRR23AA6NEV1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRR23AA6NEV1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRR23AA6NEV1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRR23AA6NEV1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRR23AA6NEV1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRR23AA6NEV1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRR23AA6NEV1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRR23AA6NEV1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRR23AA6NEV1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRR23AA6NEV1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRR23AA6NEV1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRR23AA6NEV1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRR23AA6NEV1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRR23AA6NEV1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRR23AA6NEV1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRR23AA6NEV1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRR23AA6NEV1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRR23AA6NEV1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRR23AA6NEV1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRR23AA6NEV1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRR23AA6NEV1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR23AA6NEV1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR23AA6NEV1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR23AA6NEV1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRR23AA6NEV1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRR23AA6NEV1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRR23AA6NEV1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRR23AA6NEV1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRR23AA6NEV1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRR23AA6NEV1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRR23AA6NEV1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRR23AA6NEV1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms