Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GV50

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GV50 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GV50 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GV50 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GV50 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GV50 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GV50 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GV50 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GV50 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GV50 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GV50 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GV50 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1B0GV50 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GV50 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GV50 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GV50 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GV50 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GV50 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GV50 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GV50 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GV50 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GV50 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GV50 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GV50 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GV50 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GV50 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GV50 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GV50 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GV50 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GV50 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GV50 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1B0GV50 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1B0GV50 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A1B0GV50 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GV50 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GV50 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1B0GV50 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1B0GV50 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1B0GV50 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GV50 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GV50 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1B0GV50 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1B0GV50 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1B0GV50 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1B0GV50 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1B0GV50 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GV50 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GV50 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1B0GV50 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1B0GV50 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GV50 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GV50 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GV50 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1B0GV50 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A1B0GV50 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1B0GV50 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1B0GV50 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1B0GV50 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1B0GV50 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1B0GV50 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1B0GV50 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1B0GV50 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1B0GV50 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1B0GV50 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1B0GV50 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GV50 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GV50 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GV50 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1B0GV50 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GV50 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GV50 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GV50 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GV50 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GV50 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GV50 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GV50 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GV50 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GV50 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GV50 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GV50 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GV50 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GV50 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GV50 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GV50 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GV50 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GV50 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GV50 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1B0GV50 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1B0GV50 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1B0GV50 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1B0GV50 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A1B0GV50 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A1B0GV50 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A1B0GV50 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A1B0GV50 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A1B0GV50 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A1B0GV50 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A1B0GV50 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A1B0GV50 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A1B0GV50 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A1B0GV50 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms