Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms