Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms