Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms