Protein–RNA interactions for Protein: Q96ND8

ZNF583, Zinc finger protein 583, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF583Q96ND8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF583Q96ND8 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms