Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms