Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC12Q8WUD4 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms