Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms