Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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